Ecole Thématique CNRS/INRAE UniChromRNA

Le réseau INRAE SPE REacTION (Réseau sur le rôle des mécanismes épigénétiques dans le contrôle des interactions plantes-bioagresseur, https://www6.inrae.fr/reaction/) et le GDR3E (Groupement de Recherche "Epigénétique en Ecologie et Evolution, @epiecoevol) porté par le CNRS organisent conjointement à Bordeaux l’École Thématique UniChromaRNA « ATAC-seq et sRNA-seq en écologie et agronomie ».

Cette École thématique a pour objectif de former des scientifiques sur l’utilisation de technologies permettant d’effectuer le profilage de chromatine ouverte et des petits ARN non-codants sur une variété d’organismes étudiés par les membres des deux réseaux.  Du 28/11 au 1/12 sur le site du Centre INRAE Nouvelle-Aquitaine-Bordeaux, 20 participants d’Unités CNRS et INRAE sont accueillis à MycSA.

Les deux premières journées sont dédiées à la réalisation des protocoles d’ATAC-seq et de sRNA-seq permettant de produire des librairies pour séquencer les régions chromatiniennes ouvertes et les petits ARNs régulateurs sur une variété de modèles biologiques d’intérêt agronomique et écologique. Les laboratoires de l’unité MyCSA abritents ces expérimentations de biologie moléculaire tandis que le séquençage est ensuite réalisé par la Plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux.

La troisième journée est dédiée à diverses présentations scientifiques et techniques sur l’identification des régions chromatiniennes ouvertes et le profilage des petits ARNs régulateurs. Ces présentations sont libres d'accès (amphithéâtre Colette et Josy Bové, 71 av. Edouard Bourleaux, 33140 Villenave d'Ornon.

La dernière demi-journée est consacrée à la formation à l’utilisation d’un pipeline d’analyse bioinformatique de données d’ATAC-seq.

Le financement de cet évènement est assuré par le CNRS, INRAE ainsi que la compagnie Illumina.